このサイトで採用している wiki クローン．PHP で実装され，ページのソースがファイルとして格納されているシンプルな構成．

DokuWiki 公式サイトから tar ball をダウンロードする．公式サイトでは，バージョン・言語・標準的なプラグインを選択すると，必要なモジュールをひとつのパッケージにまとめた tar ball を提供してくれる．ユーザは dokuwiki を配置するディレクトリにこれを展開するだけでよい．

パッケージを展開したディレクトリをブラウザから参照するとエラーメッセージが表示される． エラーメッセージにはインストーラを起動するためのリンクが含まれているので， これをクリックしてインストーラを起動する．

インストーラを起動すると，まずは conf や data などいくつものディレクトリについて アクセス権設定が不適切であるとのメッセージが表示される． これは httpd がユーザ _www，グループ _www で dokuwiki にアクセスすることによる． この問題を解決するには，conf と data およびその下にあるディレクトリのグループを _www に変更し， いずれのディレクトリも group writable にする．

• find conf -type d -exec chgrp _www {} ¥;
• find data -type d -exec chgrp _www {} ¥;
• find conf -type d -exec chmod 775 {} ¥;
• find data -type d -exec chmod 775 {} ¥;

アクセス権が適切に設定されると，dokuwiki の設定ウィザード・ページが開く． トップページの名前や言語など，必要な項目を好みに応じて適切に設定する． ユーザの登録もインストーラから行う．

設定ウィザードで設定を保存するとインストーラの削除が促されるので， 攻撃を受けないよう install.php を削除する． インストーラによる設定が完了すると，トップページへアクセスできるようになる． 後は管理インタフェースからプラグインの設定など，必要に応じて細かい調整を行う．

DokuWiki では，新しいバージョンがリリースされていないか常に自動的にチェックをしている． 新しいバージョンが見つかると，パンくずリストの下にアップデートを促すメッセージが表示される．

<color red>更新の前にバックアップを必ずとっておくこと．tar ball に固めておけば十分</color>

インストールと同様にDokuWiki 公式サイトから tar ball をダウンロードする． これを適当なディレクトリに展開しておき，更新に備える．

rsync を用いて更新を行う．ディレクトリ名の末尾にスラッシュ (/) を付けておくのを忘れないこと．これを忘れると current_version_dir の中に new_version_dir が作成されてしまう．

• rsync -av new_version_dir/ current_version_dir/

バージョンアップで不要になったファイルを削除する．不要になったファイル名は data/deleted.files にまとめられているので，これを使って削除する．

• grep -Ev '^($|#)' data/deleted.files | xargs -n 1 rm -vf

rsync で上書きされたファイルは，rsync を実行したユーザのグループに属してしまう．conf ディレクトリおよび data ディレクトリについては，インストール時と同様に _www グループに変更する．

• find conf -type d -exec chgrp _www {} ¥;
• find data -type d -exec chgrp _www {} ¥;
• find conf -type d -exec chmod 775 {} ¥;
• find data -type d -exec chmod 775 {} ¥;

またすでに運用されてきた dokuwiki では _www の権限でさまざまなファイルが生成されている．これらについても _www グループに属するようパーミッションを調整しておく．

• find conf -type f -exec chgrp _www {} ¥;
• find data -type f -exec chgrp _www {} ¥;
• find conf -type f -exec chmod 664 {} ¥;
• find data -type f -exec chmod 664 {} ¥;